François Chung, Ph.D.

Tag: 2012

Inspiralia 2012 - Informe tècnic

Inspiralia 2012 – Informe tècnic

|

Publicació

François Chung, Tomás Rodríguez; Automatic pollen grain and exine segmentation from microscope images; Inspiralia, Madrid, 2012.

Abstract

In this article, we propose an automatic method for the segmentation of pollen grains from microscope images, followed by the automatic segmentation of their exine. The objective of exine segmentation is to separate the pollen grain in two regions of interest: exine and inner part. A coarse-to-fine approach ensures a smooth and accurate segmentation of both structures. As a rough stage, grain segmentation is performed by a procedure involving clustering and morphological operations, while the exine is approximated by an iterative procedure consisting in consecutive cropping steps of the pollen grain. A snake-based segmentation is performed to refine the segmentation of both structures. Results have shown that our segmentation method is able to deal with different pollen types, as well as with different types of exine and inner part appearance. The proposed segmentation method aims to be generic and has been designed as one of the core steps of an automatic pollen classification framework.

Referències

Publicació

Versió publicada (arXiv)
Versió publicada (PDF)
Referència bibliogràfica (BibTeX)

Articles relacionats

APIFRESH (projecte Inspiralia)
EUE 2017 (llibre)
Inspiralia 2013 (informe tècnic)

Més informació

Inspiralia

VPH 2012 - Acta de conferència

VPH 2012 – Acta de conferència

|

Publicació

Yves Martelli, Tristan Whitmarsh, Ludovic Humbert, François Chung, Luis M. del Río Barquero, Silvana Di Gregorio, Luigi Carotenuto, Alejandro F. Frangi; A software framework for 3D reconstruction and fracture risk assessment of the proximal femur from dual-energy x-ray absorptiometry; VPH 2012: Virtual Physiological Human - Integrative approaches to computational biomedicine, London, 2012.

Abstract

In clinical routine, osteoporosis diagnosis is performed using the areal Bone Mineral Density (aBMD) computed from two-dimensional Dual-energy X-ray Absorptiometry (DXA) images. This measurement of the "projected density" gives a global marker of osteoporosis but is insufficient for an accurate quantification of non-uniform mineral deficiencies. Quantitative Computed Tomography (QCT) is one possible modality for retrieving shape and bone mineral density measurements in 3D, leading to a better characterization of the local bone quality and the fracture risk. However, due to high financial costs and a high radiation dose for the patient, this modality is rarely used in clinical routine for the follow-up of osteoporosis. In this work, we show how state-of-the-art techniques and methods for fracture risk assessment of the proximal femur using 3D analysis from single-view DXA images were brought to the research and clinical end-user, through the use of an existing open source framework for fast prototyping of clinical applications.

Referències

Publicació

Versió pre-print (PDF)
Referència bibliogràfica (BibTeX)

Article relacionat

Plataforma GIMIAS (projecte UPF)

Més informació

VPH – Virtual Physiological Human

Plataforma GIMIAS

Plataforma GIMIAS

|

Projecte UPF @Barcelona, Espanya (2012). GIMIAS (Graphical Interface for Medical Image Analysis and Simulation) és una plataforma de desenvolupament que té com a objectiu resoldre càlculs relacionats amb imatges biomèdiques i simulacions personalitzades. Aquesta plataforma és extensible mitjançant plugins desenvolupats per a problemes específics. A més, GIMIAS proporciona una plataforma de codi obert per al desenvolupament de prototips de programari.

GIMIAS està especialment dissenyat per a integrar eines del tractament d'imatges mèdiques, de la modelització computacional, dels mètodes numèrics i de la computació gràfica per a proporcionar als desenvolupadors científics i als investigadors una plataforma que els permet crear una àmplia varietat d'eines. L'objectiu de GIMIAS és combinar eines de diferents àrees de recerca i proporcionar així una plataforma de programari per a la investigació multidisciplinària, l'estudi clínic i el desenvolupament de productes comercials.

Algunes de les principals característiques de GIMIAS inclouen:

  • el processament d'imatges multimodals;
  • la creació de models personalitzats;
  • la simulació numèrica;
  • la visualització dels resultats de simulació.

Com a Enginyer de Software Científic dins de l'equip GIMIAS, el meu treball consisteix a desenvolupar, optimitzar, provar i instal·lar solucions de programari per a aplicacions ortopèdiques. Més precisament, sóc responsable del desenvolupament de programari per al projecte MySpine, finançat pel programa FP7 de la UE, i per als projectes 3D-FemOs i VERTEX, finançats per Catalunya i el programa ACC1Ó. MySpine té com a objectiu crear una eina clínica de predicció per a proporcionar als metges l'anàlisi biomecànic personalitzat dels seus pacients. Respecte als projectes 3D-FemOs i VERTEX, tenen com a objectiu millorar tant el diagnòstic de l'osteoporosi com la prevenció de les fractures de maluc (3D-FemOs) i de vèrtebres (VERTEX).

Referències

Article relacionat

VPH 2012 (acta de conferència)

Més informació

GIMIAS – Graphical Interface for Medical Image Analysis and Simulation
MySpine

Mines 2012 - Article de revista especialitzada

Mines 2012 – Article de revista especialitzada

|

Publicació

François Chung; De l'imagerie médicale à la médecine du futur; Mines Revue des Ingénieurs, 458, pp. 53-56, 2012.

Abstract

Depuis ses débuts, l'imagerie médicale a pour objectif de fournir aux radiologues des images médicales afin de les aider dans leur diagnostic. Avec l'avancée des techniques d'acquisition, les radiologues se retrouvent à analyser des images de plus en plus complexes et dans des quantités de plus en plus importantes. Du côté de la recherche, cela se traduit par une collaboration entre physique médicale, radiologie et imagerie médicale. Les physiciens ont pour objectif d'améliorer la qualité et la résolution des images médicales. Ces améliorations permettent d'aider les radiologues dans leur diagnostic et à la communauté de l'imagerie médicale de pouvoir extraire des informations plus précises. Cette collaboration permet non seulement d'avancer dans les sciences médicales (ex. étude de l'anatomie et physiologie), mais également dans les applications cliniques (ex. détection de maladies et planification de thérapie).

Referències

Publicació

Versió publicada (PDF)
Referència bibliogràfica (BibTeX)
Versió en línia (Ingénieurs Belges)

L'Ing. 2012 - Article de revista especialitzada

L’Ing. 2012 – Article de revista especialitzada

|

Publicació

François Chung; L'imagerie médicale: Un domaine d'ingénieurie et de recherche au service de la société; L'Ing., 17, pp. 10-12, 2012.

Abstract

Depuis ses débuts, l'imagerie médicale a pour objectif de fournir aux radiologues des images médicales afin de les aider dans leur diagnostic. Avec l'avancée des techniques d'acquisition, les radiologues se retrouvent à analyser des images de plus en plus complexes et dans des quantités de plus en plus importantes. Du côté de la recherche, cela se traduit par une collaboration entre physique médicale, radiologie et imagerie médicale. Les physiciens ont pour objectif d'améliorer la qualité et la résolution des images médicales. Ces améliorations permettent d'aider les radiologues dans leur diagnostic et à la communauté de l'imagerie médicale de pouvoir extraire des informations plus précises. Cette collaboration permet non seulement d'avancer dans les sciences médicales (ex. étude de l'anatomie et physiologie), mais également dans les applications cliniques (ex. détection de maladies et planification de thérapie).

Referències

Idiomes

Articles recents

Categories

Notícies

El recent & El popular

Cerca