François Chung, Ph.D.

Tag: imatge mèdica

CVIU 2013 - Article de revista científica

CVIU 2013 – Article de revista científica

|

Publicació

François Chung, Hervé Delingette; Regional appearance modeling based on the clustering of intensity profiles; In: Computer Vision and Image Understanding (CVIU), 117 (6), pp. 705-717, 2013.

Abstract

Model-based image segmentation is a popular approach for the segmentation of anatomical structures from medical images because it includes prior knowledge about the shape and appearance of structures of interest. This paper focuses on the formulation of a novel appearance prior that can cope with large variability between subjects, for instance due to the presence of pathologies. Instead of relying on Principal Component Analysis (PCA) such as in Statistical Appearance Models (SAMs), our approach relies on a multimodal intensity profile atlas from which a point may be assigned to several profile modes consisting of a mean profile and its covariance matrix. These profile modes are first estimated without any intra-subject registration through a boosted Expectation-Maximization (EM) classification based on spectral clustering. Then, they are projected on a reference mesh whose role is to store the appearance information in a common geometric representation. We show that this prior leads to better performance than the classical monomodal PCA approach while relying on fewer profile modes.

Paraules clau

  • appearance modeling
  • medical imaging
  • model-based image segmentation
  • unsupervised clustering

Referències

Publicació

Versió publicada (ScienceDirect)
Versió pre-print (PDF)
Referència bibliogràfica (BibTeX)

Articles relacionats

3D Anatomical Human (projecte INRIA)
Ph.D. Thesis 2011 (tesi doctoral)

Plataforma GIMIAS

Plataforma GIMIAS

|

Projecte UPF @Barcelona, Espanya (2012). GIMIAS (Graphical Interface for Medical Image Analysis and Simulation) és una plataforma de desenvolupament que té com a objectiu resoldre càlculs relacionats amb imatges biomèdiques i simulacions personalitzades. Aquesta plataforma és extensible mitjançant plugins desenvolupats per a problemes específics. A més, GIMIAS proporciona una plataforma de codi obert per al desenvolupament de prototips de programari.

GIMIAS està especialment dissenyat per a integrar eines del tractament d'imatges mèdiques, de la modelització computacional, dels mètodes numèrics i de la computació gràfica per a proporcionar als desenvolupadors científics i als investigadors una plataforma que els permet crear una àmplia varietat d'eines. L'objectiu de GIMIAS és combinar eines de diferents àrees de recerca i proporcionar així una plataforma de programari per a la investigació multidisciplinària, l'estudi clínic i el desenvolupament de productes comercials.

Algunes de les principals característiques de GIMIAS inclouen:

  • el processament d'imatges multimodals;
  • la creació de models personalitzats;
  • la simulació numèrica;
  • la visualització dels resultats de simulació.

Com a Enginyer de Software Científic dins de l'equip GIMIAS, el meu treball consisteix a desenvolupar, optimitzar, provar i instal·lar solucions de programari per a aplicacions ortopèdiques. Més precisament, sóc responsable del desenvolupament de programari per al projecte MySpine, finançat pel programa FP7 de la UE, i per als projectes 3D-FemOs i VERTEX, finançats per Catalunya i el programa ACC1Ó. MySpine té com a objectiu crear una eina clínica de predicció per a proporcionar als metges l'anàlisi biomecànic personalitzat dels seus pacients. Respecte als projectes 3D-FemOs i VERTEX, tenen com a objectiu millorar tant el diagnòstic de l'osteoporosi com la prevenció de les fractures de maluc (3D-FemOs) i de vèrtebres (VERTEX).

Referències

Article relacionat

VPH 2012 (acta de conferència)

Més informació

GIMIAS – Graphical Interface for Medical Image Analysis and Simulation
MySpine

Mines 2012 - Article de revista especialitzada

Mines 2012 – Article de revista especialitzada

|

Publicació

François Chung; De l'imagerie médicale à la médecine du futur; Mines Revue des Ingénieurs, 458, pp. 53-56, 2012.

Abstract

Depuis ses débuts, l'imagerie médicale a pour objectif de fournir aux radiologues des images médicales afin de les aider dans leur diagnostic. Avec l'avancée des techniques d'acquisition, les radiologues se retrouvent à analyser des images de plus en plus complexes et dans des quantités de plus en plus importantes. Du côté de la recherche, cela se traduit par une collaboration entre physique médicale, radiologie et imagerie médicale. Les physiciens ont pour objectif d'améliorer la qualité et la résolution des images médicales. Ces améliorations permettent d'aider les radiologues dans leur diagnostic et à la communauté de l'imagerie médicale de pouvoir extraire des informations plus précises. Cette collaboration permet non seulement d'avancer dans les sciences médicales (ex. étude de l'anatomie et physiologie), mais également dans les applications cliniques (ex. détection de maladies et planification de thérapie).

Referències

Publicació

Versió publicada (PDF)
Referència bibliogràfica (BibTeX)
Versió en línia (Ingénieurs Belges)

L'Ing. 2012 - Article de revista especialitzada

L’Ing. 2012 – Article de revista especialitzada

|

Publicació

François Chung; L'imagerie médicale: Un domaine d'ingénieurie et de recherche au service de la société; L'Ing., 17, pp. 10-12, 2012.

Abstract

Depuis ses débuts, l'imagerie médicale a pour objectif de fournir aux radiologues des images médicales afin de les aider dans leur diagnostic. Avec l'avancée des techniques d'acquisition, les radiologues se retrouvent à analyser des images de plus en plus complexes et dans des quantités de plus en plus importantes. Du côté de la recherche, cela se traduit par une collaboration entre physique médicale, radiologie et imagerie médicale. Les physiciens ont pour objectif d'améliorer la qualité et la résolution des images médicales. Ces améliorations permettent d'aider les radiologues dans leur diagnostic et à la communauté de l'imagerie médicale de pouvoir extraire des informations plus précises. Cette collaboration permet non seulement d'avancer dans les sciences médicales (ex. étude de l'anatomie et physiologie), mais également dans les applications cliniques (ex. détection de maladies et planification de thérapie).

Referències

LAP 2011 - Llibre

LAP 2011 – Llibre

|

Publicació

François Chung; Regional appearance modeling for model-based image segmentation: Methodological approaches to improve the accuracy of model-based image segmentation; Lambert Academic Publishing (LAP), Saarbrücken, 2011; ISBN: 978-3844322095.

Abstract

This thesis presents a novel appearance prior for model-based image segmentation. This appearance prior, denoted as Multimodal Prior Appearance Model (MPAM), is built upon an Expectation–Maximization (EM) clustering of intensity profiles with model order selection to automatically select the number of profile classes. Unlike classical approaches based on Principal Component Analysis (PCA), the clustering is considered as regional because intensity profiles are classified for each mesh and not for each vertex. Comparative results on liver profiles from Computed Tomography (CT) images show that MPAM outperforms PCA-based appearance models. Finally, methods for the analysis of lower limb structures from Magnetic Resonance (MR) images are presented. A first part deals with the creation of subject-specific models for kinematic simulations of the lower limbs. In a second part, the performance of statistical models is compared in the context of lower limb bone segmentation when only a small number of datasets is available for training.

Referències

Publicació

Llibre (Amazon)
Llibre (MoreBooks)
Referència bibliogràfica (BibTeX)

Articles relacionats

3D Anatomical Human (projecte INRIA)
Ph.D. Thesis 2011 (tesi doctoral)

Més informació

LAP – Lambert Academic Publishing

Idiomes

Articles recents

Categories

Notícies

El recent & El popular

Cerca