François Chung, Ph.D.

Tag: clinical application

GIMIAS framework

GIMIAS framework

UPF project @Barcelona, Spain (2012). GIMIAS (Graphical Interface for Medical Image Analysis and Simulation) is a workflow-oriented environment for solving biomedical image computing and simulation problems, which is extensible through the development of problem-specific plugins. In addition, GIMIAS provides an open source framework for the development of research and clinical software prototypes while allowing business-friendly technology transfer.

GIMIAS is particularly tailored to integrate tools from medical imaging, computational modeling, numerical methods and computer graphics to provide scientific developers and researchers with a software framework allowing them to build a wide variety of tools. The aim of GIMIAS is to combine tools from different areas of knowledge, thus providing a framework for multi-disciplinary research, clinical study and commercial product development.

Some of the main features of GIMIAS include:

  • multi-modal image processing;
  • personalized model creation;
  • numerical simulation;
  • visualization of simulation results.

As a Scientific Software Engineer within the GIMIAS team, my work consists in developing, optimizing, testing and installing software solutions for orthopedic applications. More precisely, I am in charge of the software development for the EU FP7-funded MySpine project and for both Catalonia ACC1Ó-funded 3D-FemOs and VERTEX projects. MySpine aims to create a clinical predictive tool to provide the clinicians with patient-specific biomechanical analysis. 3D-FemOs and VERTEX aim to improve both the diagnosis of osteoporosis and the prevention of hip (3D-FemOs) and vertebral (VERTEX) fractures.

References

Related article

VPH 2012 (conference proceeding)

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GIMIAS – Graphical Interface for Medical Image Analysis and Simulation
MySpine

L'Ing. 2012 - Magazine

L’Ing. 2012 – Magazine article

Publication

François Chung; L'imagerie médicale: Un domaine d'ingénieurie et de recherche au service de la société; L'Ing., 17, pp. 10-12, 2012.

Abstract

Depuis ses débuts, l'imagerie médicale a pour objectif de fournir aux radiologues des images médicales afin de les aider dans leur diagnostic. Avec l'avancée des techniques d'acquisition, les radiologues se retrouvent à analyser des images de plus en plus complexes et dans des quantités de plus en plus importantes. Du côté de la recherche, cela se traduit par une collaboration entre physique médicale, radiologie et imagerie médicale. Les physiciens ont pour objectif d'améliorer la qualité et la résolution des images médicales. Ces améliorations permettent d'aider les radiologues dans leur diagnostic et à la communauté de l'imagerie médicale de pouvoir extraire des informations plus précises. Cette collaboration permet non seulement d'avancer dans les sciences médicales (ex. étude de l'anatomie et physiologie), mais également dans les applications cliniques (ex. détection de maladies et planification de thérapie).

References

Publication