François Chung, Ph.D.

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VPH 2012 - Acte de conférence

VPH 2012 – Acte de conférence

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Yves Martelli, Tristan Whitmarsh, Ludovic Humbert, François Chung, Luis M. del Río Barquero, Silvana Di Gregorio, Luigi Carotenuto, Alejandro F. Frangi; A software framework for 3D reconstruction and fracture risk assessment of the proximal femur from dual-energy x-ray absorptiometry; VPH 2012: Virtual Physiological Human - Integrative approaches to computational biomedicine, London, 2012.

Abstract

In clinical routine, osteoporosis diagnosis is performed using the areal Bone Mineral Density (aBMD) computed from two-dimensional Dual-energy X-ray Absorptiometry (DXA) images. This measurement of the "projected density" gives a global marker of osteoporosis but is insufficient for an accurate quantification of non-uniform mineral deficiencies. Quantitative Computed Tomography (QCT) is one possible modality for retrieving shape and bone mineral density measurements in 3D, leading to a better characterization of the local bone quality and the fracture risk. However, due to high financial costs and a high radiation dose for the patient, this modality is rarely used in clinical routine for the follow-up of osteoporosis. In this work, we show how state-of-the-art techniques and methods for fracture risk assessment of the proximal femur using 3D analysis from single-view DXA images were brought to the research and clinical end-user, through the use of an existing open source framework for fast prototyping of clinical applications.

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VPH – Virtual Physiological Human

Plate-forme GIMIAS

Plate-forme GIMIAS

Projet UPF @Barcelone, Espagne (2012). GIMIAS (Graphical Interface for Medical Image Analysis and Simulation) est une plate-forme logicielle dont le but est de résoudre des calculs liés aux images biomédicales et aux simulations personnalisées. Cette plate-forme est extensible grâce à des plugins développés pour des problèmes spécifiques. En outre, GIMIAS fournit un environnement open source pour le développement de prototypes à des fins cliniques et de recherche.

GIMIAS est particulièrement adapté pour intégrer des outils provenant de l'imagerie médicale, de la modélisation informatique, des méthodes numériques et de l'infographie afin de fournir aux développeurs scientifiques et aux chercheurs une plate-forme logicielle de type workflow leur permettant de développer une grande variété d'outils. L'objectif de GIMIAS est de combiner des outils provenant de différents domaines de recherche et fournir ainsi une plate-forme pour la recherche multi-disciplinaire, l'étude clinique et le développement de produits commerciaux.

Quelques-unes des principales caractéristiques de GIMIAS sont:

  • le traitement d'images multi-modales;
  • la création de modèles personnalisés;
  • la simulation numérique;
  • la visualisation de résultats de simulation.

En tant qu'Ingénieur Logiciel Scientifique au sein de l'équipe GIMIAS, mon travail consiste à développer, optimiser, tester et installer des solutions logicielles pour des applications orthopédiques. Plus précisément, je suis en charge du développement logiciel pour le projet européen MySpine, financé par le programme FP7 de l'UE, et pour les projets 3D-FemOs et VERTEX, financés par la Catalogne et le programme ACC1Ó. MySpine a pour objectif de créer un outil clinique de prédiction afin de fournir aux cliniciens une analyse biomécanique personnalisée de leurs patients. Quant aux projets 3D-FemOs et VERTEX, ils ont pour objectif d'améliorer à la fois le diagnostic de l'ostéoporose et la prévention des fractures de la hanche (3D-FemOs) et des vertèbres (VERTEX).

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